早期认为鱼类肠道中存在寥寥可数、结构简单的微生物群落，随着鱼类肠道微生态学的发展，人们逐渐认识到鱼类肠道中存在着种类繁多、数量庞大的微生物群落。复杂的生活环境、不同的发育阶段、多变的食物来源等因素都会导致鱼类肠道微生物多样性及结构发生变化。鱼类肠道微生物与栖息环境所形成的微生态系统在保持动态平衡时，能够维持宿主的肠道健康。大量研究显示稳态中的微生态系统能够调节肠道微生物群落的平衡、改善肠道微生物群落的组成，从而对鱼类生长发育、营养代谢、免疫调控等过程具有促进作用。本文综述了鱼类肠道微生物的研究方法、多样性和功能，总结了温度、盐度及水体饵料等环境因子对鱼类肠道微生物的影响，以期为今后鱼类肠道微生物的研究发展提供启发和参考。

根据2018年8月23日—9月26日4艘灯光敷网渔船开展大面调查的数据，利用相对重要性指数、Margalef物种丰富度指数、Shannon-Wiener多样性指数、Pielou均匀度指数等指标，初步分析了西北太平洋公海海域秋季游泳动物种类组成和多样性特征，共鉴定游泳动物种类45种，分隶于9目21科37属。其中，软骨鱼纲2目2科2属2种、辐鳍鱼纲6目17科31属39种、头足纲1目2科4属4种。所有站位的平均渔获率为1 126.64 kg/h、41 727.11 ind/h。调查中鱼类占较大优势，其中日本鲭（Scomber japonicus）及远东拟沙丁鱼（Sardinops melanostictus）占据绝对优势地位，相对重要性指数分别为3 154.11和2 525.95，这可能与该生产区域历史上为日本鲭和远东拟沙丁鱼等中上层鱼类的重要索饵区域有关。该海域秋季游泳动物多样性指数H′平均值为0.70，范围为0.00~1.74；丰富度指数D平均值为0.36，范围为0.00~1.08；均匀度指数J′平均值为0.48，范围为0.00~0.97。其优势种明显，但种类组成较为单一，多样性水平较低，这原因可能是因为大洋海区种类较少，种间竞争小，互相间生态位挤占程度较低。多样性水平基本呈现南高北低的趋势，调查海域的北部区域为经济鱼种的渔场，因此多样性水平偏低。